MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams4 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020978	AGG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478467561
2	NC_020978	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	478467561
3	NC_020978	TAA	3	9	93	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478467561
4	NC_020978	AGT	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478467561
5	NC_020978	GA	3	6	212	217	50 %	0 %	50 %	0 %	478467561
6	NC_020978	AAG	2	6	324	329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467561
7	NC_020978	CAA	2	6	338	343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467561
8	NC_020978	AGT	2	6	364	369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478467561
9	NC_020978	GTG	2	6	380	385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478467561
10	NC_020978	GGGA	2	8	394	401	25 %	0 %	75 %	0 %	478467561
11	NC_020978	CAG	2	6	413	418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467561
12	NC_020978	GCT	2	6	532	537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467561
13	NC_020978	AGTG	2	8	544	551	25 %	25 %	50 %	0 %	478467561
14	NC_020978	ATT	2	6	557	562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478467561
15	NC_020978	TGGC	2	8	578	585	0 %	25 %	50 %	25 %	478467561
16	NC_020978	GCC	2	6	601	606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478467561
17	NC_020978	TGC	2	6	660	665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467561
18	NC_020978	ATT	2	6	672	677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478467561
19	NC_020978	CGA	2	6	694	699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467561
20	NC_020978	TAT	2	6	836	841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478467561
21	NC_020978	AG	3	6	844	849	50 %	0 %	50 %	0 %	478467561
22	NC_020978	GAA	2	6	883	888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467561
23	NC_020978	AGA	2	6	912	917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467561
24	NC_020978	AGA	2	6	966	971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467561
25	NC_020978	CAA	2	6	1039	1044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467561
26	NC_020978	AATG	2	8	1063	1070	50 %	25 %	25 %	0 %	478467561
27	NC_020978	TTG	2	6	1182	1187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478467561
28	NC_020978	CTC	2	6	1211	1216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467561
29	NC_020978	GAT	2	6	1273	1278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478467561
30	NC_020978	GAT	2	6	1327	1332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478467561
31	NC_020978	GAAGGA	2	12	1357	1368	50 %	0 %	50 %	0 %	478467561
32	NC_020978	ATG	2	6	1390	1395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478467561
33	NC_020978	CTAT	2	8	1397	1404	25 %	50 %	0 %	25 %	478467561
34	NC_020978	CTT	2	6	1610	1615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467561
35	NC_020978	CAG	2	6	1675	1680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467561
36	NC_020978	A	6	6	1800	1805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020978	AAG	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020978	TGG	2	6	1833	1838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020978	CTT	2	6	1840	1845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020978	T	7	7	1844	1850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020978	A	6	6	1855	1860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020978	AAGG	2	8	1906	1913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020978	ATG	2	6	1933	1938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478467562
44	NC_020978	GTG	2	6	1939	1944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478467562
45	NC_020978	TCC	2	6	1948	1953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467562
46	NC_020978	AGC	2	6	1962	1967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467562
47	NC_020978	T	6	6	1981	1986	0 %	100 %	0 %	0 %	478467562
48	NC_020978	AGC	2	6	1989	1994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467562
49	NC_020978	AAG	2	6	2000	2005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467562
50	NC_020978	TAC	2	6	2038	2043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467562
51	NC_020978	GCT	2	6	2048	2053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467562
52	NC_020978	AGTA	2	8	2086	2093	50 %	25 %	25 %	0 %	478467562
53	NC_020978	AAC	2	6	2146	2151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467562
54	NC_020978	AGA	2	6	2158	2163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467562
55	NC_020978	TC	3	6	2195	2200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020978	T	6	6	2236	2241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020978	TAA	2	6	2248	2253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020978	T	7	7	2258	2264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020978	TC	3	6	2267	2272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020978	A	6	6	2330	2335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020978	AGA	2	6	2414	2419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467563
62	NC_020978	ATC	2	6	2421	2426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467563
63	NC_020978	TGC	2	6	2441	2446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467563
64	NC_020978	ATGA	2	8	2490	2497	50 %	25 %	25 %	0 %	478467563
65	NC_020978	GATA	2	8	2528	2535	50 %	25 %	25 %	0 %	478467563
66	NC_020978	CAT	2	6	2565	2570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467563
67	NC_020978	AGA	2	6	2594	2599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467563
68	NC_020978	AAG	2	6	2623	2628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467563
69	NC_020978	GGA	2	6	2658	2663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478467563
70	NC_020978	AG	3	6	2750	2755	50 %	0 %	50 %	0 %	478467564
71	NC_020978	ATC	2	6	2787	2792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467564
72	NC_020978	TC	3	6	2831	2836	0 %	50 %	0 %	50 %	478467564
73	NC_020978	ATA	2	6	2937	2942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478467564
74	NC_020978	AAC	2	6	2962	2967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467564
75	NC_020978	GGT	2	6	3016	3021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478467564
76	NC_020978	AAT	2	6	3122	3127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478467564
77	NC_020978	TTC	2	6	3157	3162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467564
78	NC_020978	GCA	2	6	3176	3181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467564
79	NC_020978	GGA	2	6	3224	3229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478467564
80	NC_020978	CAG	2	6	3243	3248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467564
81	NC_020978	GTT	2	6	3260	3265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478467564
82	NC_020978	GGT	2	6	3352	3357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478467564
83	NC_020978	GA	3	6	3418	3423	50 %	0 %	50 %	0 %	478467564
84	NC_020978	T	6	6	3425	3430	0 %	100 %	0 %	0 %	478467564
85	NC_020978	AAG	2	6	3510	3515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467564
86	NC_020978	ATT	2	6	3572	3577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478467564
87	NC_020978	TTG	2	6	3624	3629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478467564
88	NC_020978	CATG	2	8	3706	3713	25 %	25 %	25 %	25 %	478467564
89	NC_020978	AAG	2	6	3735	3740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467564
90	NC_020978	AAG	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467564
91	NC_020978	CAG	2	6	3792	3797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467564
92	NC_020978	GCT	2	6	3863	3868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467564
93	NC_020978	TGTGA	2	10	3878	3887	20 %	40 %	40 %	0 %	478467564
94	NC_020978	TTCC	2	8	4011	4018	0 %	50 %	0 %	50 %	478467564
95	NC_020978	AAG	2	6	4029	4034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467564
96	NC_020978	CAG	2	6	4079	4084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467564
97	NC_020978	GGA	2	6	4166	4171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478467564
98	NC_020978	AAT	2	6	4176	4181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478467564
99	NC_020978	TTGAA	2	10	4234	4243	40 %	40 %	20 %	0 %	478467565
100	NC_020978	ATT	2	6	4256	4261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478467565
101	NC_020978	TGA	2	6	4286	4291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478467565
102	NC_020978	TTTA	2	8	4409	4416	25 %	75 %	0 %	0 %	478467565
103	NC_020978	GTA	2	6	4518	4523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478467565
104	NC_020978	GAGAA	2	10	4528	4537	60 %	0 %	40 %	0 %	478467565
105	NC_020978	AGA	2	6	4565	4570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467565
106	NC_020978	ATCC	2	8	4709	4716	25 %	25 %	0 %	50 %	478467565
107	NC_020978	GAA	2	6	4749	4754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467565
108	NC_020978	CGT	2	6	4881	4886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467565
109	NC_020978	A	7	7	4925	4931	100 %	0 %	0 %	0 %	478467565
110	NC_020978	GTT	2	6	4932	4937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478467565
111	NC_020978	GAAAA	2	10	4965	4974	80 %	0 %	20 %	0 %	478467565
112	NC_020978	A	7	7	4971	4977	100 %	0 %	0 %	0 %	478467565
113	NC_020978	TGA	2	6	5069	5074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478467565
114	NC_020978	AT	3	6	5111	5116	50 %	50 %	0 %	0 %	478467565
115	NC_020978	TTACA	2	10	5120	5129	40 %	40 %	0 %	20 %	478467565
116	NC_020978	TTG	2	6	5164	5169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478467565
117	NC_020978	TTC	2	6	5305	5310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467565
118	NC_020978	TCT	2	6	5397	5402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467565
119	NC_020978	AGA	2	6	5417	5422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467565
120	NC_020978	GTT	2	6	5444	5449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478467565
121	NC_020978	GACG	2	8	5456	5463	25 %	0 %	50 %	25 %	478467565
122	NC_020978	GGT	2	6	5492	5497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478467565
123	NC_020978	AAAGCT	2	12	5538	5549	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478467565
124	NC_020978	TTGG	2	8	5559	5566	0 %	50 %	50 %	0 %	478467565
125	NC_020978	CTC	2	6	5596	5601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467565
126	NC_020978	AGC	2	6	5627	5632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467565
127	NC_020978	GCA	2	6	5652	5657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020978	A	6	6	5663	5668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020978	AGA	2	6	5679	5684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020978	ATT	2	6	5746	5751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478467566
131	NC_020978	TCT	2	6	5764	5769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467566
132	NC_020978	GCT	2	6	5810	5815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467566
133	NC_020978	GTCTT	2	10	5816	5825	0 %	60 %	20 %	20 %	478467566
134	NC_020978	GAT	2	6	5845	5850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478467566
135	NC_020978	TC	3	6	5861	5866	0 %	50 %	0 %	50 %	478467566
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137	NC_020978	ACG	2	6	5883	5888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467566
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